吐鲁番市第二人民医院地处吐鲁番市中心地段。始建于1945年，是一所学科齐全的综合性“二级甲等”医院，是吐鲁番城镇职工、城镇居民和新型农村合作医疗定点医疗机构。医院开放床位500张，现有在职职工650人。年门诊量25万余人次，住院病人2.5万余人次，手术6000余台次，固定资产总值1.5亿元。
设有呼吸、消化、内分泌、心脑血管、肾病（肾透）内科及普外、肛肠外科、骨科、神经外科、泌尿外科、妇科、产科、儿科（新生儿科）、急诊科、重症医学科、眼科、口腔科、耳鼻喉科、手术麻醉科、中医科等临床学科，医技科室齐全，下设分院1所。
医院拥有e8、e9等高端彩超、128层ct 、超导磁共振、大型c型臂等先进医疗设备。医院坚持科技兴院、人才强院战略。技术力量较强，有一批经验丰富的学科带头人。
拥有层流洁净手术室，可常规开展腹腔镜手术、经输尿管镜下钬激光碎石术、经尿道前列腺汽化电切术、嵴柱手术、全髋、膝关节置换术、脑出血手术、胃肠镜下微创治疗及食道支架放置术、胃镜电切射频治疗、种植牙、心脏介入治疗等一系列高难度手术技术。
医院领导班子团结、奋进、开拓、创新、求实，不断强化科学管理，深化医院体制及人事分配制度改革，全面实施计算机信息网络化管理，实现his、lis、pacs、电子病历、oa办公系统的互联互通，全面开展优质护理服务和临床路径管理，开设便民门诊、门诊及住院患者一卡通、“银医通”服务，方便患者就医。